Consommation d'alcool et troubles liés à la consommation d'alcool : exposer une architecture génétique de plus en plus partagée
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Consommation d'alcool et troubles liés à la consommation d'alcool : exposer une architecture génétique de plus en plus partagée

Jun 25, 2023

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Dans ce numéro, Kember et al. (1) font état d'un effort impressionnant visant à identifier les contributeurs génétiques à la fois à la consommation d'alcool et aux troubles liés à la consommation d'alcool (AUD) dans la plus grande étude à ce jour, à la fois en termes de taille d'échantillon et en termes d'inclusion de groupes de population non européens. Les auteurs capitalisent également sur la construction unique du Million Veteran Program (MVP), avec des données longitudinales provenant des dépistages de consommation d'alcool et des diagnostics de troubles liés à la consommation d'alcool dans les dossiers de santé, pour mieux affiner les phénotypes et les analyses, ce que peu d'autres études peuvent accomplir. Dans ces analyses, effectuées au sein et entre les ascendances, ils rapportent 24 variantes indépendantes notables (19 locus) associées à la consommation d'alcool, quantifiées par les scores du test d'identification des troubles liés à la consommation d'alcool – Consommation (AUDIT-C) (2), et 26 variantes indépendantes ( 21 locus) associés à un trouble lié à la consommation d’alcool. Les auteurs effectuent également des associations basées sur les gènes, effectuent des analyses de médiation, calculent des corrélations génétiques, construisent des scores de risque polygénique et réalisent une étude d'association à l'échelle du phénomène dans deux ensembles de données externes : la biobanque Vanderbilt (BioVU) et la biobanque britannique. Grâce à ces analyses, ils concluent que les différences dans les locus associés, les différences dans les corrélations génétiques et phénotypiques et la variation génétique non médiatrice soutiennent la conclusion selon laquelle la consommation d'alcool et l'AUD ont des architectures génétiques sous-jacentes distinctes. Nous soutenons que, comparés à d'autres publications récentes sur la génétique de la consommation et des troubles de l'alcool, les résultats présentés par Kember et al. souligner la nécessité de minimiser l'hétérogénéité des traits en réduisant les erreurs de classification des individus qui s'abstiennent désormais de consommer de l'alcool mais qui ont des antécédents de troubles liés à la consommation d'alcool. Lorsque l’hétérogénéité des traits est minimisée, les fondements génétiques globaux de la consommation et des troubles liés à l’usage d’alcool sont, dans leur composition et leur schéma, assez similaires.

Compte tenu de l'importance accordée aux corrélations génétiques en tant qu'indication d'architectures génétiques partagées ou distinctes pour la consommation d'alcool et l'AUD, nous pensons qu'il est prudent de donner un bref aperçu des corrélations génétiques rapportées pour ces caractères. Les corrélations génétiques rapportées dans des études jumelles suggèrent des corrélations modérées à élevées (plage rg, 0,45 à 0,99) entre plusieurs traits de consommation d'alcool et des corrélations élevées entre les traits de consommation d'alcool et la consommation problématique d'alcool (3, 4). En utilisant la régression des scores de déséquilibre des liaisons croisées, les corrélations génétiques signalées entre les traits de consommation d'alcool et la consommation problématique d'alcool ou les troubles liés à la consommation d'alcool variaient considérablement (Tableau 1). Dans l’une des premières études portant sur des individus d’ascendance européenne, la corrélation génétique signalée entre le score AUDIT et les troubles liés à la consommation d’alcool était négligeable (rg = 0,08) (5). Notez que plusieurs des comparaisons du tableau 1 ont utilisé les mêmes cohortes ou le même trait (par exemple, le score AUDIT-C) dans différentes cohortes, illustrant que des différences apparemment inoffensives dans la dérivation des traits et la composition des échantillons peuvent conduire à de grandes différences dans les corrélations génétiques estimées. . Il est important de noter que l'étude de Kember et al. compare la consommation d'alcool et les troubles liés à la consommation d'alcool mesurés chez les mêmes individus, ce qui élimine les biais dans les corrélations génétiques estimées provenant de la sélection des échantillons et des maladies comorbides. Lorsque les auteurs concentrent leurs analyses sur ceux qui déclarent consommer actuellement de l’alcool et excluent ceux qui s’abstiennent de consommer de l’alcool, dont 15 % ont des antécédents de troubles liés à la consommation d’alcool, la corrélation génétique entre la consommation d’alcool et les troubles liés à la consommation d’alcool augmente (rg=0,86-1). , et les corrélations génétiques pour les individus d'ascendance africaine sont très élevées (rg = 0,98–1). Ces résultats soulignent que l’architecture génétique de la consommation d’alcool et des troubles liés à la consommation d’alcool est principalement partagée.

TABLEAU 1. Corrélations génétiques signalées entre les caractéristiques de consommation d'alcool et la consommation problématique d'alcoola

0), who were previously shown to affect genetic associations (1, 20). In excluding those who abstain, the authors only “lost” one to two genome-wide significant loci, despite losing almost a quarter of their original sample, suggesting greater power from higher phenotypic precision and reduced misclassification. Kember et al. also observed an increase in the SNP heritability of both AUDIT-C score and AUD diagnosis, further demonstrating the positive impact of reducing bias and improving phenotypic precision in understanding the genetic architecture both of consumption and of AUD (18, 20)./p>1 million individuals [preprint]. strongMedRxiv/strong, January 30, 2023. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2023.01.24.23284960v2 Google Scholar/p>